少年三国志的主角是汉灵帝的幼子，自幼被仙师左慈收为徒弟，在渭水仙境中过着与世隔绝的生活。他每日跟随左慈习文演武，虽然生活逍遥自在，但因年少好动，经常偷偷前往人间，目睹了乱世中百姓的疾苦，逐渐心生匡扶汉室的志向。这段独特的成长经历赋予了他超凡的武艺和仙法能力，也塑造了他心怀天下的性格特质。
主角在陇西偶遇被董卓大军围攻的刘关张三人时，毅然出手相助，运用仙法击散董卓大军。这一战不仅展现了他强大的实力，也让他被刘关张三人的英雄气概所感动。当刘备提及灵帝早夭的幼子时，主角并未透露自己的真实身份，而是豪迈地宣告自己将成为平定乱世的王者。这种刻意隐藏身份却又胸怀大志的矛盾心理，体现了主角复杂的内心世界。
主角决定离开仙境游历人间，这个选择标志着他从避世修炼到入世救世的重大转变。他拜别恩师左慈时，随身携带着父亲灵帝悄悄交给他的传国玉玺，这件象征皇权的宝物暗示了他肩负着复兴汉室的重任。左慈天下大势，合久必分、分久必合的预言，为主角的冒险之旅埋下了伏笔，也预示着三国乱世终将被统一的宿命。
在游戏设定中，主角没有固定形象和姓名，玩家可以自定义其外观和名称。这种设计巧妙地保留了历史神秘感，同时增强了玩家的代入感。主角的特殊身份和成长经历使他能够超越普通武将的局限，游走于各大势力之间，为玩家提供了独特的叙事视角和游戏体验。
主角的生活经历与游戏的核心玩法紧密相连。他掌握的仙法对应着游戏中的特殊技能系统，而他对人间疾苦的认知则反映在游戏的剧情任务中。玩家通过培养主角，实际上是在延续这个传奇人物的成长轨迹，从懵懂少年逐步成长为能够影响三国格局的关键人物。这种将角色背景与游戏机制有机结合的设定，大大提升了游戏的可玩性和代入感。
